Во времена династий Шан и Чжоу район Фэнтай был пригородом Цзичэна, древнего Пекина. В начале правления династии Чжоу он принадлежал Цзи, а позже Янь.
Во времена династии Цинь основал уезд Цзи.
Во времена династии Западная Хань уезд Цзи располагался в уезде Иньсян на юге, а город Иньсян находился в районе современного Баотая. Во времена династии Восточная Хань покинул Иньсян и вошел в уезд Цзи.
Во второй год правления Тан Цзяньчжуна (781) западная часть уезда Цзи была преобразована в уезд Юду. Центральная часть современного района Фэнтай (Лугоуцяо и Хуасян) в то время принадлежала уезду Юду, восточная часть (Наньюаньсян) - уезду Цзи.
В первый год Хуйтон династии Ляо (938) уезд Цзи был преобразован в уезд Цзибэй, а в первый год Кайтая династии Ляо (1012) Юду и Цзибэй были преобразованы в Ваньпин и Сицзинь.
Во времена династии Цзинь Сицзинь был переименован в Дасин.
Во времена династии Юань Наньюаньсян в восточной части Фэнтая принадлежал уезду Дасин, к югу от уезда Бэйгун на западе - уезду Лянсян, а большая часть центральной части - уезду Ваньпин.
Во времена династии Мин Наньюаньсян к востоку от современных ворот Юань принадлежал уезду Дасин, северная часть Ванцзо на западе и территория вокруг Дахуэйчана принадлежали уезду Фаншань, а южная часть деревни Ванчжуан—Гуайцунь принадлежала уезду Лянсян.
В конце династии Цин восточная часть Фэнтая и северная часть Дахунмэнь были разделены на городские районы.
В июне 1928 года восточная часть района Фэнтай относилась к южным пригородам, а центральная и западная части - к уездам Ваньпин, Фаншань и Лянсян.
В январе 1949 года Фэнтай, Чансиньдянь, Наньюань и близлежащие районы были отнесены к городу Бэйпин, и одно за другим были созданы народные правительства районного уровня. В апреле того же года город Бэйпин был разделен на районы, район Наньюань стал 23-м районом, район Фэнтай стал 25-м районом, а Чансиньдиань стал 26-м районом. В июне того же года первоначальные 15-й и 23-й района были объединены в 14-й район, южная часть первоначального 16-го района была объединена в 25-й район, став 15-м районом, а первоначальный 26-й район был преобразован в 18-й район.
В июне 1950 года с одобрения Пекинского муниципального народного правительства и Административного совета Центрального народного правительства 18-й район Пекина (Чансиндянь), который был упразднен и объединен в 15-й район. В августе того же года муниципальное народное правительство Пекина приняло решение связать название пригорода с городской территорией, и бывший 14-й район (Наньюань) был переименован в 11-й, а 15-й район (Фэнтай) - в 12-й.
В 1952 году уезд Ваньпин был упразднен и были созданы районы Фэнтай, Наньюань и Шицзиншань, которые вошли в состав Пекина.
В 1958 году большая часть районов Наньюань и Шицзиншань были объединены в район Фэнтай.
В июле 1963 года было создано муниципальное управление Шицзиншань, и пять улиц Бэйсинань, улица Цзиндин, Яблоневый сад, гробница Гуаннин и Новый Древний город были переданы из района Фэнтай в управление Шицзиншань.
В августе 1967 года был восстановлен район Шицзиншань, и коммуна Шицзиншань была выделена из состава района Фэнтай.
В конце 1990 года самой западной точкой района был Мааньшань (116°4' восточной долготы), а самой восточной - деревня Донсидаокоу (116°28' восточной долготы), расположенная на расстоянии 35 километров друг от друга; самой южной точкой была южная граница деревни Хэчжаоюнь (39°46' северной широты), а самой северной точкой был недавно открытый канал к северу от деревни Цинта (39°54'), с севера на юг ширина составляет 14 километров.